Prelec je trenersku karijeru započeo u Dinamovom omladinskom pogonu. Zatim je samostalno vodio Goricu, s kojom je osvojio 2. HNL, nakon toga Istru.
Hrvatski nogometni trener Ivan Prelec u ožujku prošle godine je preuzeo danski klub Vejle, koji je tada bio na začelju prvoligaškog društva. U posljednjih 10 utakmica sezone klub je skoro spasio od ispadanja, no na kraju je ostao kratak za jedan bod.
Vodstvo Vejlea to nije okarakteriziralo kao neuspjeh, već je hrvatskom treneru dalo priliku da pripremi iduću sezonu, a on je to iskoristio na najbolji način i u nedjelju će u posljednjem kolu drugoligaške konkurencije protiv Vendsyssela na domaćem terenu proslaviti ekspresni povratak u elitni rang.
Prelec je trenersku karijeru započeo u Dinamovom omladinskom pogonu. Zatim je samostalno vodio Goricu, s kojom je osvojio 2. HNL, nakon toga Istru.